Martha e Jonathan Kent sono una coppia felicemente sposata, vivono nella loro fattoria in una piccola città del Kansas, Smallville. Una casa normale, una vita normale, fino al giorno in cui una pioggia di meteoriti si abbatte sulla città distruggendo e trasformando la vita degli abitanti. Martha e Jonathan vengono salvati da un bambino, uno scricciolo di circa tre anni che solleva il furgone di Jonathan come fosse un giocattolo. Con in braccio il piccolo sconosciuto i Kent si avventurano nelle vicinanze e scoprono qualcosa che non è un meteorite, qualcosa che non è umano, qualcosa che ha portato lì il piccolo che Martha tiene tra le braccia: un’astronave aliena.
Clark cresce curato amorevolmente dai Kent; è consapevole di essere “speciale”, ma i suoi genitori non gli hanno mai raccontanto la verità. Dopo essere sopravvissuto a un incidente mortale causato dalla porche di Lex Luthor, Clark chiede spiegazioni e Jonathan finalmente gli mostra la “culla” con la quale è atterrato sul pianeta Terra.
Clark cerca di venire a patti con la sua vera natura: da un lato usa i suoi poteri per aiutare il prossimo e mettere un freno alle mutazioni che le meteore hanno inflitto agli abitanti di Smallville, dall’altro cerca di scoprire quanto più è possibile sulla sua vera identità.