Jack, Kate, Sawyer e Hurley sono sulla spiaggia. Mentre Jack cura Kate, i due si mettono d’accordo sull’uccidere il falso Locke (l’uomo in nero). Così si addentrano nella foresta. Il gruppo si divide, Hurley e Kate più avanti e Jack e Sawyer più indietro. Davanti a Hurley compare il bambino biondo che ha fatto la sua apparizione davanti a Locke varie volte, una delle quali mentre quest’ultimo era in compagnia di Jack. Il bambino è in realtà Jacob che chiede a Hugo le ceneri raccolte da Ilana, affermando che gli appartengono. Hurley insegue il giovane, che, dopo aver afferrato le ceneri, fugge via. Quando lo raggiunge si trova dinanzi Jacob con un falò acceso, alimentato dalle sue stesse ceneri. Jacob rivela ad Hurley che all’estinzione del fuoco lui sparirà per sempre e gli ordina di richiamare lì tutti i sopravvissuti. Intanto la scena si sposta su Ben, Richard e Miles che giungono alle case della Dharma per recuperare del c4 nel nascondiglio in cui Ben credeva di poter evocare “il mostro”. Lì troveranno Zoe, la spia di Charles: quest’ultimo, che entra nella casa più tardi, ordina a Zoe di controllare Locke, che nel frattempo è appena sceso sull’isola principale grazie a una canoa. La spia ritorna alla casa dando le informazioni, così il gruppo appena formato decide di chiudersi dentro lo stanzino segreto nella casa di Ben, anche se quest’ultimo vorrebbe fare i conti con Locke a costo di rimanere ucciso. Così, mentre Miles fugge via, Richard rimane con Ben. I due escono dall’edificio aspettando l’inevitabile, ma Richard non è preoccupato: sicuro del fatto che Locke lo voglia come alleato, vuole convincerlo a non fare del male a Ben. I due, ormai all’aperto, sentono il rumore del “mostro”: questo, con una velocità impressionante, afferra Richard, che tra urla atroci viene portato via. Ben, spiazzato e impaurito, vede arrivare Locke, il quale gli propone un accordo: se Ben ucciderà per lui, nel momento in cui lascerà l’isola egli concederà a Ben il diritto di viverci. Ben accetta e rivela il nascondiglio di Charles e Zoe. Entrando dentro al ripostiglio vi trovano i due. Locke fa delle domande a Zoe, ma Charles le ordina di non rispondere. Di colpo Locke le taglia il collo, affermando che la donna era divenuta inutile visto che non poteva parlare. Locke chiede al superstite cosa fosse venuto a fare sull’isola, minacciandolo di uccidere sua figlia Penelope se non avesse risposto alla domanda. Charles afferma qualcosa su Desmond, ma si rifiuta di continuare la conversazione di fronte a Ben. Charles aveva detto a Ben che era stato Jacob a chiedergli di tornare. Quando Ben si allontana, Charles sussurra qualcosa all’orecchio di Locke, ma mentre gli sta passando le informazioni Ben gli spara, uccidendolo, poiché non voleva dargli l’opportunità di salvare la figlia Penelope. Locke, comunque, ha ricevuto le informazioni e Ben vuole sapere chi altro deve uccidere per completare l’accordo. Sull’isola è giunta sera e si vede che Jack, Sawyer, Hugo e Kate arrivano da Jacob e che tutti quanti riescono a vederlo. A quest’ultimo dispiace della morte di Jin, Sun e Sayid e spiega che uno di loro sopravvissuti dovrà essere il suo successore e continuare la sua missione di proteggere l’isola dal “mostro”, e per questo parla loro della luce al centro dell’isola. Dice di aver scelto loro perché sono soli come lui e hanno bisogno dell’isola, ma non sarà lui a scegliere, tra di loro dovranno decidere chi dovrà proseguire la missione. Dopo un breve silenzio Jack si offre volontario e viene portato a una sorgente. Dopo un rituale gli viene fatta bere dell’acqua da una coppa, proprio come aveva fatto Jacob. Jacob gli dice che ora sono uguali e gli rivela che quando Jack si era svegliato nella foresta dei Bamboo dopo il disastro aereo, era molto vicino alla luce. La scena ritorna a Locke, che ha portato Ben al pozzo dove era intrappolato Desmond. Quest’ultimo sarebbe dovuto essere stato ucciso da Sayid, ma scoprono che invece è fuggito con una corda. Locke rivela a Ben ciò che Charles gli ha detto: Desmond era l’ultima spiaggia per salvare l’isola, a causa delle sue doti di resistenza all’elettromagnetismo. Locke dice che lo troverà e userà le sue doti, invece, per distruggere l’isola. Nella Los Angeles del 2004, John si presenta da Jack e accetta finalmente di sottoporsi all’operazione. Nel frattempo Sayid, Kate e Desmond salgono su un furgone della polizia per essere trasferiti in un altro carcere. L’autista del furgone, Ana Lucia, d’accordo con Desmond e Hugo, li fa però fuggire dopo aver ricevuto da quest’ultimo un grosso compenso.