Il papero alieno Howard (che, insieme a Beverly Switzler, è l’unico personaggio che proviene dal fumetto originale) viene trasportato a Cleveland (Ohio) da un esperimento fallito con un laser. Il fascio di luce ha trascinato con sé anche uno degli Occulti Super Sovrani dell’Universo, alieni intenzionati a distruggere la Terra. Ad aiutare Howard (ritratto da varie controfigure travestite da anatre), è la cantante rock Beverly Switzler (Lea Thompson (in origine il ruolo era stato proposto all’allora sconosciuta Tori Amos). Andati al centro ricerche responsabile dell’accaduto, sfuggono alla sua esplosione. Il papero, Beverly e un apprendista scienziato suo amico (Tim Robbins) riescono a fuggire, ma poi dovranno fermare l’Occulto Super Sovrano dell’Universo, entrato nel corpo dello scienziato Walter Jenning (Jeffrey Jones).